創(chuàng)圣紀0011年的地球由于11年前的大異變人類喪失了23的人口　　南極冰山溶化1萬2千年前滅亡的亞特蘭蒂亞重現(xiàn)于世擁有雙翼的「墮天翅族」蘇醒了他們將生物機械兵器「神話獸」接連送入人類的都市捕獲人類攝取生體能源「Purana」　　另一方面人類決心反擊從海底遺跡發(fā)掘岀三臺組合（hybrid）戰(zhàn)斗機「Vector Machine」這是1萬2千年前將墮天翅族逼入滅亡絕境的傳說中的兵器Vector Machine經過合體「機械天使Aquarion」即將現(xiàn)身　　要啟動Aquarion需要能與機體的機械生命感應和共鳴稱為「Element」的人這要求特別敏銳的五感和純真的靈魂因此十五歲左右的少年少女們被選為機師集中起來　　而后「機械天使Aquarion」合體的時刻終于到來…